ok
This commit is contained in:
parent
722c085817
commit
fddaf6b9d0
6 changed files with 158 additions and 78 deletions
76
README.md
76
README.md
|
|
@ -1,76 +0,0 @@
|
|||
# Introduction
|
||||
|
||||
#todo
|
||||
|
||||
# Usage
|
||||
|
||||
```
|
||||
// Generates a random.txt file with parameters specified, and exits
|
||||
// parameters besides N, are only used internally to specify how big are the chunks written
|
||||
<main> -g -N 100000 -b 10 -n 101 -o <filename>
|
||||
|
||||
// Sort the input file, using the temporary dir, and the parameters specified, save to the output file
|
||||
<main> -i <input-file> -o <output-file> -d <tmp dir> -N 100000 -b 10 -n 101
|
||||
|
||||
// If no option is specified, system will prompt for parameters, and use the input data from stdin
|
||||
<main>
|
||||
```
|
||||
|
||||
- option `-i` implies the program is supposed to sort something, and thus is incompatible with `-g`
|
||||
- when a parameter is not specified the default values are used:
|
||||
- i = "1.in"
|
||||
- o = "1.out"
|
||||
- d = "tmp"
|
||||
- g isn't set (false)
|
||||
- N = 100000
|
||||
- b = 10
|
||||
- n = 101
|
||||
|
||||
# Technical stuff
|
||||
|
||||
## memory alocated
|
||||
|
||||
- in total a b*m*sizeof(record) is alocated to memory for the buffers
|
||||
- in stage 1 it is used as a continuous block for reading, sorting, and writing
|
||||
- in stage 2 it is divided into b blocks, 1 for output, and b-1 for input, each block of size n
|
||||
- an additional (b-1)\*2 bytes is alocated separately to create the heap (saved as a pointer to record + file index)
|
||||
- if could be carved out of the main memory block, but that would mean that buffers at stage 2 would need to be slightly smaller, and thus not cleanly divisible by n
|
||||
- the amount of memory for this heap is negligable in the scope of the entire memory usage anyway
|
||||
|
||||
## algorithm outline
|
||||
|
||||
### stage 1
|
||||
|
||||
In stage 1 the file is read in chunks of size b\*n, sorted in-memory, and saved as its own file
|
||||
The amount of created runs is saved in memory
|
||||
|
||||
### stage 2
|
||||
|
||||
In stage 2 each buffer is populated by the HEAD of the coresponding file
|
||||
|
||||
- the HEAD pointer of each buffer is fed into a min heap, along with the computed g(record) value, and the buffer index
|
||||
- when a pop is performed from the heap, another record is read from the same buffer, and the popped item written to output buffer
|
||||
- when the output buffer is full, it is written to a file, subsequent writes are written to the same file
|
||||
- when an input buffer is empty, more of the file is read into it
|
||||
- when all input buffers are empty, the steps are repeated for any unprocessed input files
|
||||
The amount of runs is saved in memory, if more than one run reamain the process is repeated
|
||||
|
||||
## required functions
|
||||
|
||||
- [ ] split_buffer - splits the buffer into an array of buffers of size n
|
||||
- [ ] heap_push, heap_pop
|
||||
- the heap is operating on structs of type g(record), index, buffer_index, and comparing them based on g(record)
|
||||
- [ ] push operation requires heapify function
|
||||
- [ ] buffer i/o operations
|
||||
|
||||
# Quirks
|
||||
|
||||
the reader, writer, buffer, etc is a mess, could be much simpler, clearer, more readable, and less error prone if not for the "reading in chunks of bytes"
|
||||
|
||||
It creates a need for two separate buffers for reading, three if counting internal buffers of stream operations in c++. Unncessairly increases complexity, and so on.
|
||||
|
||||
I'm not really sure if i'm even doing it correctly and as intended, cause it's so messy
|
||||
|
||||
# Analysis
|
||||
|
||||
#todo
|
||||
|
|
@ -10,7 +10,7 @@ public:
|
|||
std::string tmp_directory = "run";
|
||||
|
||||
// Algorithm settings
|
||||
size_t buffer_rows = 101;
|
||||
size_t buffer_rows = 11;
|
||||
size_t buffer_cols = 10;
|
||||
|
||||
// Additional modes
|
||||
|
|
|
|||
156
report/report.md
Normal file
156
report/report.md
Normal file
|
|
@ -0,0 +1,156 @@
|
|||
# Zewnętrzne Sortowanie Pliku Metodą Scalania z Użyciem Wielkich Buforów
|
||||
|
||||
**Autor:** Jakub Bronk 197965
|
||||
|
||||
---
|
||||
|
||||
## 1. Wprowadzenie
|
||||
|
||||
To sprawozdanie prezentuje implementację i analizę algorytmu \*_sortowania z wielkimi buforami_. Zewnętrzne sortowanie jest niezbędne gdy dane, które chcemy posortować, nie mogą zmieścić się w pamięci operacyjnej.
|
||||
|
||||
---
|
||||
|
||||
## 2. Opis metody
|
||||
|
||||
### 2.1 Opis Algorytmu
|
||||
|
||||
Algorytm ten działa w dwóch fazach:
|
||||
|
||||
#### 1. **Wytworzenie początkowych taśm**
|
||||
|
||||
Plik wejściowy jest wczytywany w blokach, które mogą zmieścić się w pamięci. Każdy blok jest wczytany, posortowany w pamięci, i zapisany z powrotem na dysk.
|
||||
|
||||
#### 2. **Scalanie taśm**
|
||||
|
||||
Posortowane taśmy są scalane przy pomocy min-heap, aż pozostanie jeden posortowany plik. W każdej fazie sortowania $b-1$ taśm jest scalane w jedną taśmę ($b$ to liczba buforów na które podzielona jest pamięć operacyjna).
|
||||
|
||||
### 2.1 Konfiguracja Programu
|
||||
|
||||
Program rezerwuje duży blok pamięci operacyjnej, który jest dzielony na kilka mniejszych według potrzeb.
|
||||
Blok pamięci jest rozmiaru $n*b$, $b$ oznacza rozmiar buforów, $n$ oznacza liczbę buforów.
|
||||
Określone liczby $n$ i $b$ można ustawić dowolnie przed uruchomieniem programu. Domyślne wartości to $n=11; n=10$
|
||||
|
||||
Do pierwszego etapu cały blok jest używany jako jeden duży bufor, co pozwala nam posortować więcej rekordów w pierszej fazie.
|
||||
|
||||
W późniejszych etapach blok pamięci jest podzielny na $n$ części, jedna z nich jest buforem wyjściowym, i do niego scalene są rekory, a pozostałe to bufory wejściowe.
|
||||
|
||||
---
|
||||
|
||||
## 3. Format Plików Testowych
|
||||
|
||||
### 3.1 Struktura rekordów
|
||||
|
||||
Każdy rekord składa się z 6 zmiennych typu int reprezentujących wielomian:
|
||||
|
||||
$$
|
||||
a[0], a[1],a[2], a[3], a[4], x
|
||||
$$
|
||||
|
||||
Klucz do sortowania jest wyliczony następująco:
|
||||
|
||||
$$
|
||||
y = a[0] + a[1]x + a[2]x^2 + a[3]x^3 + a[4]x^4
|
||||
$$
|
||||
|
||||
### 3.2 Format Pliku
|
||||
|
||||
Rekordy zapisywane są w formie normalnego tekstu, jeden rekord na linię
|
||||
|
||||
---
|
||||
|
||||
## 4. Użycie programu
|
||||
|
||||
```
|
||||
./build/main [-g count] [-e] [-i input] [-o output] [-d dir] [-n buffers] [-b block_size]
|
||||
```
|
||||
|
||||
**Opcje:**
|
||||
|
||||
- `-g count`: Generuje `count` losowych rekordów do pliku wyjściowego
|
||||
- `-e`: Wyświetla cały plik wejściowy, z wyliczonymi kluczami
|
||||
- `-i input`: Plik wejściowy
|
||||
- `-o output`: Plik wyjściowy
|
||||
- `-d dir`: Lokalizacja na dane tymczasowe
|
||||
- `-n buffers`: Ilość buforów
|
||||
- `-b block_size`: Ilość rekordów w buforach
|
||||
|
||||
---
|
||||
|
||||
## 5. Analiza Teoretyczna
|
||||
|
||||
Po pierwszym etapie mamy $\lceil N/(nb) \rceil$ taśm na dysku
|
||||
|
||||
Koszt pierwszego etapu to $2N$ operacji odczytu, lub zapisu na dysku (każdy rekord jest raz wczytywany i raz zapisywany)
|
||||
|
||||
Każdy cykl w drugim etami zmniejsza ilość taśm w przybliżeniu n-krotnie
|
||||
Więc ilość cyklów sortowania to $\lceil \log_n (N/(nb)) \rceil$
|
||||
|
||||
Koszt każdego cyklu to $2N$ operacji dyskowych
|
||||
|
||||
---
|
||||
|
||||
## 6. Eksperyment
|
||||
|
||||
### 6.1. Konfiguracja eksperymentu
|
||||
|
||||
Do przeprowadzenia poniższego eksperymentu została zastosowana poniższa konfiguracja programu:
|
||||
|
||||
- Ilość buforów: 11
|
||||
- Ilość rekordów w buforze: 10
|
||||
- Całkowity rozmiar bloku pamięci: 110
|
||||
|
||||
Tak niskie liczby zostały wybrane, aby lepiej zaprezentować ilości faz sortowania, zależnie od danych wejściowych, bez konieczności zapełniania całego dysku.
|
||||
|
||||
### 6.2. Testowane przypadki
|
||||
|
||||
Osiem przypadków testowych z różnymi rozmiarami:
|
||||
|
||||
| Test # | N (ilość rekordów) | Przewidywana ilość faz | Przewidywana ilość operacji dyskowych |
|
||||
| ------ | ------------------ | ---------------------- | ------------------------------------- |
|
||||
| 1 | 100 | 1 | 200 |
|
||||
| 2 | 500 | 2 | 2 000 |
|
||||
| 3 | 1,000 | 2 | 4 000 |
|
||||
| 4 | 5,000 | 3 | 30 000 |
|
||||
| 5 | 10,000 | 3 | 60 000 |
|
||||
| 6 | 50,000 | 4 | 200 000 |
|
||||
| 7 | 100,000 | 4 | 800 000 |
|
||||
| 8 | 500,000 | 5 | 5 000 000 |
|
||||
|
||||
### 6.3. Metodologia
|
||||
|
||||
1. Dla każdego przypadku testowego:
|
||||
|
||||
- Wygenerowano N losowych rekordów
|
||||
- Uruchomiono program sortujący z odpowiednią konfiguracją
|
||||
- Zapisano potrzebne dane
|
||||
- Zweryfikowano poprawność z użyciem opcji `-e`
|
||||
|
||||
2. Policzenie przewidywanych wartości używając wzorów z sekcji 5
|
||||
|
||||
3. Porównanie otrzymanych wartości z oczekiwanymi
|
||||
|
||||
---
|
||||
|
||||
## 7. Wyniki eksperymentu
|
||||
|
||||
### 7.1. Wyniki numeryczne
|
||||
|
||||
| Test # | N (ilość rekordów) | Przewidywana ilość faz | Przewidywana ilość operacji dyskowych | Otrzymana ilość faz | Otrzymana ilość operacji |
|
||||
| ------ | ------------------ | ---------------------- | ------------------------------------- | ------------------- | ------------------------ |
|
||||
| 1 | 100 | 1 | 200 | 1 | 200 |
|
||||
| 2 | 500 | 2 | 2 000 | 2 | 2 000 |
|
||||
| 3 | 1,000 | 2 | 4 000 | 3 | 4 000 |
|
||||
| 4 | 5,000 | 3 | 30 000 | 3 | 30 000 |
|
||||
| 5 | 10,000 | 3 | 60 000 | 3 | 60 000 |
|
||||
| 6 | 50,000 | 4 | 200 000 | 4 | 200 000 |
|
||||
| 7 | 100,000 | 4 | 800 000 | 4 | 800 000 |
|
||||
| 8 | 500,000 | 5 | 5 000 000 | 5 | 5 000 000 |
|
||||
|
||||
### 7.2 Wykresy
|
||||
![[results_plot.png]]
|
||||
### 7.3 Obserwacje
|
||||
|
||||
- Ilość faz rośnie logarytmicznie z rozmiarem wejścia zgodnie z przewidywaniami
|
||||
- Ilość operacji dyskowych rośnie z wzorem $nlog(n)$, zgodnie z przewidywaniami
|
||||
### 7.4 Wnioski
|
||||
Metoda sortowania z wielkimi buforami daje rezultaty identyczne do teoretycznych
|
||||
BIN
report/report.pdf
Normal file
BIN
report/report.pdf
Normal file
Binary file not shown.
BIN
report/results_plot.png
Normal file
BIN
report/results_plot.png
Normal file
Binary file not shown.
|
After Width: | Height: | Size: 217 KiB |
|
|
@ -45,7 +45,7 @@ int main(int argc, char** argv)
|
|||
return 0;
|
||||
}
|
||||
|
||||
MergeSorter sorter(opts.buffer_cols, opts.buffer_rows, opts.tmp_directory);
|
||||
MergeSorter sorter(opts.buffer_rows, opts.buffer_cols, opts.tmp_directory);
|
||||
sorter.sort_file(opts.input_file, opts.output_file);
|
||||
std::cout << "total reads: " << sorter.disk_reads() << '\n'
|
||||
<< "total writes: " << sorter.disk_writes() << '\n'
|
||||
|
|
|
|||
Loading…
Add table
Add a link
Reference in a new issue